Prestupové okno je riadené podľa úrovne čistoty čistej plochy vyššej úrovne, ktorá je s ním spojená. Napríklad prestupové okno spojené medzi kódovacou miestnosťou a plniacou miestnosťou by sa malo spravovať podľa požiadaviek plniacej miestnosti. Po práci je obsluha v čistom priestore zodpovedná za čistenie vnútorných povrchov prenosového okna a zapnutie UV sterilizačnej lampy na 30 minút.
1. Materiály vstupujúce a vystupujúce z čistej plochy musia byť prísne oddelené od toku osôb a vstupujúce a vystupujúce zo špeciálneho priechodu pre materiály vo výrobnej dielni.
2. Pri vstupe materiálov sa surové a pomocné materiály vybalí osoba zodpovedná za prípravný pracovný proces alebo sa exteriér vyčistí a potom sa cez prestupové okno pošle do priestorov na dočasné uskladnenie surovín a pomocného materiálu dielne; vnútorné obalové materiály sa odstránia z vonkajšej dočasnej skladovacej miestnosti po odstránení vonkajšieho obalu, odošle sa do vnútorného oddelenia cez dodacie okno. Integrátor dielne a osoba zodpovedná za procesy prípravy a vnútorného balenia riešia odovzdanie materiálov.
3. Pri prechode cez priechodné okno musí byť prísne implementovaná požiadavka "jeden otvorený a jeden zatvorený" pre vnútorné a vonkajšie dvere priechodného okna a tieto dve dvere sa nedajú otvoriť súčasne. Otvorte vonkajšie dvere, aby ste vložili materiál a najprv zatvorili dvere, potom otvorte vnútorné dvere, aby ste materiál vybrali, zatvorte dvere a tak ďalej.
4. Keď sa materiály v čistej oblasti odošlú, materiály by sa mali najprv prepraviť na príslušnú medziľahlú stanicu materiálu a potom presunúť z čistej oblasti podľa opačného postupu pri vstupe materiálov.
5. Všetky polotovary prepravované z čistého priestoru musia byť odoslané z dodacieho okna do vonkajšej dočasnej skladovacej miestnosti a potom prevedené do vonkajšej baliacej miestnosti cez logistický kanál.
6. Materiály a odpady, u ktorých je vysoká pravdepodobnosť, že spôsobia znečistenie, by sa mali prepravovať do nečistej oblasti z jej vyhradeného prestupného okna.
7. Po vstupe a výstupe materiálu včas vyčistite čistiacu miestnosť alebo miesto medziľahlej stanice a hygienu prestupného okna, zatvorte vnútorné a vonkajšie priechodné dvere prestupového okna a urobte dobrú prácu pri čistení a dezinfekcii.